Valērijs Šabala karjeru iesāka FK Daugava Rīga komandā. Jauniešu vecumā tika uzskatīts par vienu no sava vecuma talantīgākajiem futbolistiem. Bijis Okartes Futbola akadēmijas dalībnieks.
Pirmais treneris bija Vladimirs Beļajevs, kura vadībā Valērijs arī debitēja Virslīgas čempionātā 2009. gada 15. oktobrī - vien pāris dienas pēc tam, kad bija apritējuši 15 gadi. Pirmajā sezonā viņš piedalījās divās spēlēs. Tajā sezonā FK Daugava Rīga nespēja noturēties Virslīgā, un jauno gadu Valērijs sagaidīja jau JFK Olimps rindās.
Šabala guva pirmos vārtus Virslīgas čempionātā 2010. gada 23. aprīlī spēlē pret Skonto FC. Viņš bija 15 gadus un 193 dienas vecs, tobrīd kļūstot par visu laiku jaunāko vārtu guvēju Latvijas Virslīgas čempionāta vēsturē. Šo rekordu 2014. gada 10. jūnijā pārspēja Jānis Grīnbergs, gūstot vārtus 15 gadu un 102 dienu vecumā.
2011. gadā pārstāvēja Skonto FC. Sezonas izskaņā saņēma Ilmāra Liepiņa balvu kā Latvijas jaunatnes gada labākais futbolists. Šo atzinību Valērijs izpelnījās arī gadu vēlāk. 2012. gada sezonu noslēdza ar 11 gūtajiem vārtiem Virslīgā, bet 2013. gadā guva 15 jau vārtus. 2011. gadā kopā ar Skonto FC triumfēja TrioBet Baltijas līgā, bet 2012. gadā izcīnīja Latvijas kausu.
2013. gadā tika atzīts par SMScredit.lv Virslīgas čempionāta labāko uzbrucēju. Galvaspilsētas kluba rindās spēlēja arī UEFA Eiropas līgas kvalifikācijā, gūstot vārtus uzvarētā mājas spēlē pār Liberecas Slovan no Čehijas (2:1).
Tobrīd vēl pārstāvot Skonto FC krāsas Valērijs regulāri devās atrādīties dažādiem ārzemju klubiem. Potenciālo pircēju vidū bija arī klubi Turcijas un Itālijas. 2014. gada janvārī Valērijs pievienojās pazīstamajam Beļģijas klubam Club Brugge. Pirmās komandas sastāvā viņam iekļūt neizdevās, un turpmākos gadus Valērijs pavadīja īslaicīgās īrēs sekojošos klubos: Skonto FC, Anorthosis Famagusta (Kipra), Jablonec (Čehija), Miedź Legnica (Polija), Příbram (Čehija), DAC Dunajská Streda (Slovākija) un Riga FC.
2017. gada augustā Valērijs Šabala parakstīja divu gadu līgumu ar Polijas 1. līgas klubu Podbeskidzie Bielsko-Biała. 2018./2019. gada sezonas pirmajā pusē Valērijs guva 8 vārtus, izpelnoties labākā uzbrucēja balvu šajā sezonas nogrieznī. Sezonas turpinājumā viņš savam kontam pievienoja vēl četrus rezultatīvus sitienus un ar 12 vārtiem kļuva par 1. līgas labāko vārtu guvēju. 2019. gada jūnijā Šabala lika punktu spēlēšanai Podbeskidzie Bielsko-Biała vienībā, kurā kopā iekrāja 63 spēles, 22 vārtus un 3 rezultatīvas piespēles.
Spēlējis arī dažāda vecuma Latvijas jauniešu izlasē. Valstsvienībā debitēja Aleksandra Starkova vadībā pārbaudes spēlē 2013. gada 24. maijā Dohā pret Kataru (1:3), nospēlējot pirmās 74 minūtes. Pirmos vārtus guva četras dienas vēlāk, 28. maijā, pārbaudes spēlē Duisburgā pret Turciju, izceļoties ar diviem vārtu guvumiem un palīdzot Latvijas izlasei izcīnīt neizšķirtu (3:3). 2014. gada 3. septembrī Valērijs guva divus vārtus Rīgā pārbaudes spēlē pret Armēniju (2:0), bet Euro 2016 kvalifikācijā iesita katrā no divām spēlēm atkal pret turkiem, abiem mačiem noslēdzoties neizšķirti. 2018. gada Pasaules kausa izcīņas kvalifikācijas ciklā Valērijs iesita trīs vārtus divās spēlēs pret Andoru – divus no tiem Skonto stadionā cikla pēdējā mačā pārliecinošā uzvarā ar 4:0. Tobrīd Valērijs ar 12 vārtiem iekļuva Latvijas izlases visu laiku rezultatīvāko spēlētāju labāko desmitniekā, panākot tādas mūsu futbola izcilības kā pussargu Aleksandru Cauņu un aizsargu Mihailu Zemļinski.
2014., 2016. un 2018. gadā Valērijs palīdzēja Latvijas izlases izcīnīt Baltijas kausu.